Diversidade genética do novo coronavírus SARS-CoV-2 na região do Alentejo (Portugal): estudo retrospetivo e atual

Abstract

No final de 2019, surgiu o vírus SARS-CoV-2, responsável pela infeção COVID-19. Devido à alta transmissibilidade e à ausência de terapias e vacinas direcionadas para este vírus, verificou-se uma elevada morbilidade dos pacientes, em particular dos que necessitaram de tratamento hospitalar. Com a rápida disseminação desta doença, a testagem em massa e a vacinação foram consideradas as ferramentas principais para a travagem da transmissão desta na população. Entretanto, este vírus sofreu diversas mutações, provocando o surgimento de novas variantes. Com este estudo pretendeu-se avaliar a incidência e prevalência das variantes do SARS-CoV-2 na região do Alentejo (Portugal), tendo por base os utentes do Hospital do Espírito Santo de Évora. Segundo os resultados obtidos, em 2021, destacou-se a variante Delta como sendo a variante predominante durante o período de julho e novembro. Durante o ano de 2022, a variante Ómicron e suas descendentes predominaram, nomeadamente as linhagens BA.1, BA.2 e BA.5; Genetic diversity of the SARS-CoV-2 coronavirus on the Alentejo region (Portugal): retrospective and current approach ABSTRACT: SARS-CoV-2 emerged in 2019, causing the infection COVID-19. High morbidity was observed in COVID-19 patients, especially in those who needed to be hospitalised, due to the elevated risk of transmission and the lack of specific therapies and vaccines against this virus. With the rapid dissemination of this disease in Portugal, mass testing and the administration of vaccines were key factors to prevent COVID-19 transmission among the community. However, this virus rapidly acquired various mutations, resulting in the emergence of new variants. The aim of this study was to evaluate the incidence and prevalence of the SARS-Cov-2 variants in the Alentejo region, Portugal, based on COVID-19 patients of the Espírito Santo hospital in Évora. According to our results, in 2021, the Delta variant became the dominant variant during the summer. However, the Omicron variant and its descendants, namely lineages BA.1, BA.2 and BA.5, became the dominant variant throughout 2022.