Caracterização polifásica de fungos filamentosos zygomycetes com interesse em biotecnologia ambiental

Abstract

Neste trabalho desenvolveram-se estudos de identificação e classificação taxonómica de fungos Mucorales, dos géneros Absidia, Circinella, Cunninghamella, Gongronella e Rhizopus, com vista a correlacionar microrganismos do mesmo taxa e a construir um esquema de identificação polifásica com integração de dados morfológicos, proteómicos e genómicos. Procedeu-se à caracterização micro- e macro- morfológica das estirpes, estudos moleculares com amplificação de regiões satélite e estudos de identificação espetral por MALDI-TOF MS. Os estudos morfológicos permitiram a caraterização das estirpes pela análise da cor, textura das colónias e das estruturas vegetativas e de reprodução assexuada. Os estudos moleculares de análise filogenética da região ITS permitiram o agrupamento das estirpes ao nível da espécie e possibilitaram a reclassificação taxonómica de algumas das estirpes em estudo. Os estudos de MALDI-TOF MS e de análise polimórfica por M13-PCR proporcionaram uma boa diferenciação das estirpes, corroborando os resultados da filogenia; POLYPHASIC APPROACH OF ZYGOMYCETES FILAMENTOUS FUNGI WITH INTEREST IN ENVIRONMENTAL BIOTECHONOLOGY ABSTRACT: This work comprises a set of identification and taxonomic classification studies of Mucorales fungi, genera Absidia, Circinella, Cunninghamella, Gongronella and Rhizopus, in order to correlate microorganisms from the same taxa and achieved a polyphasic approach, integrating morphological, proteomic and genomic results. Therefore, micro- and macro- morphological characterization of the strains, molecular studies with amplification of satellite regions and the spectral characterization studies by MALDI-TOF MS were carried out. The morphological studies allowed the strain characterization, based on the color and texture of the colonies as well as their vegetative and reproductive structures. Phylogenetic analysis based on ITS region enabled grouping the strains at species level and allowed the taxonomic reclassification of some of the strains under study. Studies of MALDI-TOF MS analysis and polymorphic M13-PCR provided a good differentiation of the strains within the species, corroborating the results of phylogeny.