http://hdl.handle.net/10174/213 2026-04-05T19:36:07Z http://hdl.handle.net/10174/40775 Title: Uncovering the potential of Bacillus amyloliquefaciens 14C2 against plant- parasitic nematodes Authors: Gordo, João; Barbosa, Pedro; Espada, Margarida; Vicente, Claudia SL Abstract: Plant-parasitic nematodes (PPN) are major constraints to agriculture worldwide, affecting nearly all cultivated crops. The sustainable control of these PPN is currently focused on biological strategies with low impact on the environmental and human health, such as biological control. The genus Bacillus is one of the most studied bacterial genera expressing antagonistic potential against several important PPN. Their nematicidal effect is usually linked to the production of several toxic molecules (e.g., shingosine produced by B. cereus S2 or secreted proteases of endophytic B. cereus BCM2, both against the PPN Meloidogyne incognita; or other proteases of B. cereus i.24 and Lysobacter capsica i.17 against the root-lesion nematode Pratylenchus penetrans). Previously, we have evaluated the nematicidal potential of endophytic and soil-inhabiting PGPR from genus Bacillus against P. penetrans. In this work, we analysed the complete genome sequence of B. amyloliquefaciens (= B. velezensis) 14C2 in search of potential proteases to be explored as natural nematicides. The genome size of B. amyloliquefaciens 14C2 is 3,528,213 bp with an average of GC content of 46.5% and consists of one chromosome of 3.9 Mbp encoding for 3935 protein-coding and 131 RNA genes. Several serine proteases (C2_GM001392, C2_GM001840, C2_GM001358, C2_GM003264 and C2_GM004060), known to be related with nematicidal effect in other bacteria, have been identified and validated. Moreover, 247 proteins involved in biosynthesis of secondary metabolites pathways, also a source of nematoxic molecules, were identified. The B. amyloliquefaciens 14C2 genome has shown to be a potential source for the development of new biotechnological nematicides. 2025-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/10174/40749 Title: Nematicidal activity of phytochemicals against the root-lesion nematode Pratylenchus penetrans and effect on potato host Authors: Barbosa, Pedro; Faria, JMF; Figueiredo, AC; Mota, Manuel; Vicente, Claudia SL Abstract: The root-lesion nematode, Pratylenchus penetrans, is among the most harmful plant parasitic nematodes for crop productivity worldwide, parasitizing a significant number of plant hosts. Common pest management strategies rely on the use of synthetic chemical nematicides, which impose serious concerns regarding their impacts on human health and the environment. In the present study, the nematicidal activity of 40 phytochemicals was assayed against P. penetrans using standard direct and indirect contact methodologies. The nematode was remarkably insensitive to the tested phytochemicals at the highest concentration tested, 2 mg/mL, seldomly reaching full mortality after a 24 h exposure period. However, high activities were obtained for benzaldehyde, carvacrol, 3-octanol, and thymol, in comparison to the other phytochemicals or the synthetic nematicide oxamyl; about 1 h was required for carvacrol, 3-octanol, and thymol to kill half population. Mortality percentages obtained from the indirect contact bioassays for the most active compounds were lower than the ones from direct contact, not exceeding 65%. For these, 25 min were required to kill half of the population. Growth chamber pot assays were performed separately for carvacrol and thymol by mixing the compound solutions (6 mg / Kg substrate) in the soil of pots with potato plants. Pots were placed under growth chamber conditions (23°C and 50% relative humidity day, 10°C and 70% relative humidity night; 14h photoperiod). Physiological parameters were assessed 7, 14, 21 and 28 days after plant emergence from the soil surface. No statistical differences (p>0.05) were recorded between the control treatment and the two phytochemicals in terms of growth. These compounds are good candidates for the development of biopesticides for a more sustainable root-lesion nematode management strategy. 2025-01-01T00:00:00Z http://hdl.handle.net/10174/40633 Title: MONITORIZAÇÃO DAS PREFERÊNCIAS ALIMENTARES DE OVINOS E SUA RELAÇÃO COM OS NÍVEIS DE PROTEÍNA BRUTA EM PASTAGENS DE SEQUEIRO NO MONTADO Authors: Carreira, Emanuel; Serrano, João; Silva, Flávio; Borges, Nuno; Mata, Ester; Cruz, Margarida; Geraldo, Ana; Braz, Maria; Travessa, Sandra; Perloiro, Tiago; Charneca, Rui; Pereira, Alfredo Abstract: Os ovinos em pastoreio apresentam muitas vezes seletividade, com diversos efeitos no solo, na pastagem e nos ecossistemas em geral. O objetivo deste estudo foi avaliar a relação entre as preferências alimentares de ovinos e os níveis de proteína bruta (PB) em pastagens de sequeiro no Montado, num período sem restrições alimentares. O estudo, desenvolvido no âmbito do Projeto “SUMO – Sustentabilidade do Montado”, foi realizado no campo experimental “ECOSPAA”, localizado na Herdade da Mitra – Universidade de Évora. Uma área de 4 ha foi subdividida em 4 parcelas experimentais, sujeitas a diferentes tratamentos (com e sem aplicação de calcário dolomítico × 2 encabeçamentos, 1 CN/ha e 2,5 CN/ha). Em cada parcela foram previamente identificados, georreferenciados e marcados fisicamente 12 pontos de amostragem, representativos das comunidades botânicas existentes. Em quatro datas de 2024 (20 de março, 18 de abril, 13 de maio e 20 de junho), quando a disponibilidade de biomassa não era limitativa foram efetuadas observações dos animais no campo, registando-se os locais de pastoreio. Estas observações foram efetuadas por observadores treinados, com recurso a binóculos, a cada 10 minutos, do nascer ao pôr do sol. No dia anterior a estas datas, foi medida a altura da pastagem, seguida de corte para determinação laboratorial do teor de PB. Os resultados destas observações mostraram que, a 20 de março (PB > 14% em todos os pontos de amostragem) e a 20 de junho (PB < 10% em todos os pontos de amostragem) o teor de PB não parece ter influenciado as preferências alimentares dos animais, embora se tenha verificado seletividade em todos os tratamentos. Contudo, nas datas intermédias, quando a PB apresentou uma acentuada variabilidade espacial (aproximadamente entre 8 e 20%), os animais manifestando igualmente pastoreio seletivo, preferiram áreas com teor mais elevado de PB. Este estudo indica: i) sem limitações de biomassa, a seletividade de pastoreio pelos ovinos verificou-se em todos os tratamentos, mesmo com encabeçamentos elevados; ii) os ovinos preferiram áreas com maiores teores de PB, quando a sua variabilidade era elevada em cada parcela. 2025-11-11T00:00:00Z http://hdl.handle.net/10174/40632 Title: Aplicação de tecnologias de monitorização do solo e da pastagem em explorações pecuárias extensivas para uma produção mais sustentável – caso de estudo no projeto TID4AGRO. Authors: Carreira, Emanuel; Borges, Nuno; Serrano, João; Belo, Anabela; Rato, Ana Elisa; Braz, Maria; Travessa, Sandra; Charneca, Rui Abstract: Este trabalho visa apresentar metodologias e tecnologias de monitorização de solo e da pastagem em sistemas de pastoreio com diferentes espécies pecuárias no âmbito do projeto TID4AGRO “Tecnologias avançadas, inovadoras e digitais para o sector agroalimentar da EUROACE” financiado no âmbito do programa INTERREG (2024-2026). O objetivo final é produzir informação científica que possa ser útil aos criadores de animais para uma gestão do pastoreio mais produtiva e resiliente. Os ensaios decorrem em duas parcelas de Montado, uma de 27 ha (na herdade da Tapada dos Números, Cabeço de Vide, Portugal) e outra de 33 ha (na finca Cubillos, Villar del Rey, Espanha) onde existe um histórico de pastoreio multi-espécie, nomeadamente com bovinos, ovinos e suínos. As parcelas, sujeitas a pastoreio rotacional, têm instaladas pastagens permanentes biodiversas sob Montado de azinho e de sobro. Em cada parcela foram identificadas e georreferenciadas 8 áreas de amostragem de 10 m × 10 m, no centro das quais foi colocada uma caixa de exclusão de pastoreio (1 m × 1 m). Ao longo do ciclo vegetativo da pastagem, antes e após os períodos de pastoreio, são efetuados diversos procedimentos de monitorização, dentro e fora das caixas de exclusão, nomeadamente: i) medição da compactação do solo, com recurso a um cone penetrómetro eletrónico; ii) colheita de amostras de solo, para determinação do teor de humidade; iii) fotografias da pastagem; iv) medição da altura da pastagem com régua graduada; v) estimativa da altura da pastagem e da sua produtividade, utilizando um Medidor de Prato Ascendente (“Rising Plate Meter”); vi) determinação da produtividade (expressa em matéria seca e matéria verde por hectare), da qualidade da pastagem (teores de proteína bruta e de fibra) e da composição florística; vi) recolha de espetros de infravermelho próximo (NIR) para posterior análise; vii) recolha de dados de satélite, com o objetivo de avaliar o potencial da monitorização remota da pastagem. Este projeto visa: i) perceber que efeitos têm as opções tomadas pelos gestores agrícolas no solo, na pastagem e no ecossistema Montado; ii) produzir conhecimento científico que possa auxiliar em tomadas de decisão mais informadas. 2025-11-11T00:00:00Z